208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3344 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  95.82 
 
 		 373 aa  682    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  100 
 
 		 360 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  82.17 
 
 		 360 aa  594  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  55.06 
 
 		 349 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  50.3 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  42.98 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  41.3 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  40.54 
 
 		 345 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  37.85 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  38.8 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  33.85 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  31.47 
 
 		 351 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  34.8 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  29.27 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  35.43 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  26.01 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  25.11 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  28.69 
 
 		 329 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  26.36 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  28.34 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  28.49 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  26.49 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  29.8 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  26.86 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  27.67 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  26.45 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  28.22 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  23.65 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  30.25 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  24.6 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  23.24 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  30.98 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  21.99 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1741  Phage integrase  26.38 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  26.73 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  27.19 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  26.79 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  25.37 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  26.53 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  23.97 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1375  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  28.02 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  27.13 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  27.43 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  28.27 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  25.27 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  28.3 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  28.66 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  29.5 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  28.43 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  25.74 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  33.33 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  24.76 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  28.51 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  29.08 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  27.27 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  27.62 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  30.15 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  27.2 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  32.26 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  27.2 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  31.43 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  27.23 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  27.56 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  25.81 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  25.38 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  28.08 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  32.26 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  27.12 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  25.23 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  24.16 
 
 		 348 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  28.33 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  23.91 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  26.76 
 
 		 409 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  28.27 
 
 		 204 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.56 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  26.67 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  25.67 
 
 		 334 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  23.46 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  25.6 
 
 		 339 aa  53.9  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  23.05 
 
 		 356 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  26.83 
 
 		 391 aa  53.1  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  26.32 
 
 		 354 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  26.32 
 
 		 354 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  24.75 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  25.38 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  29.84 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  26 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  23.91 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  26.03 
 
 		 389 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  25.9 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  23.05 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  30.43 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>