51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2653 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  100 
 
 		 421 aa  864    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  39.95 
 
 		 388 aa  249  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  28.31 
 
 		 349 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  26.65 
 
 		 344 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  27.09 
 
 		 349 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  26.07 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  26.16 
 
 		 360 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 335 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  24.75 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  24.58 
 
 		 351 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  25.91 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  25 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  25.93 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  25.23 
 
 		 311 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  23.19 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  25.63 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  25.1 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5668  hypothetical protein  70.45 
 
 		 44 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.39438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  24.61 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  22.26 
 
 		 370 aa  57  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  24.07 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  23 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  22.19 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  27.13 
 
 		 197 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  23.38 
 
 		 346 aa  53.9  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  24.12 
 
 		 389 aa  53.5  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  24.58 
 
 		 383 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  23.46 
 
 		 297 aa  50.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  21.94 
 
 		 344 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  24.35 
 
 		 362 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  23.28 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 294 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  23.47 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  21.08 
 
 		 341 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  25.85 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  30.77 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  21.97 
 
 		 344 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  22.02 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  22.02 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  21.56 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  20.19 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  21.56 
 
 		 356 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1375  phage integrase family protein  23.69 
 
 		 336 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  32.1 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  29.28 
 
 		 284 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  29.67 
 
 		 359 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  23.57 
 
 		 344 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  29.67 
 
 		 359 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  29.47 
 
 		 359 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>