160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1150 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  97.07 
 
 		 359 aa  685    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 341 aa  709    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  61.14 
 
 		 342 aa  418  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  61.19 
 
 		 339 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  58.66 
 
 		 329 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  49.55 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  48.49 
 
 		 338 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  46.83 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  47.45 
 
 		 338 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  47.15 
 
 		 338 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0995  integrase protein  97.83 
 
 		 147 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000161367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  63.83 
 
 		 200 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  34.21 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  32.53 
 
 		 349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.34 
 
 		 344 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  25.07 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  27.38 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.28 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  29.18 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  27.38 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  31.29 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  31.88 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  25.98 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  31.54 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  30.95 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  31.29 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  30.95 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  31.44 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  30.95 
 
 		 339 aa  102  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  25.7 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  28.76 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  30.95 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  28.38 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  26.91 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  27.5 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  26.01 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  29.91 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  24.43 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6332  integrase family protein  25.78 
 
 		 423 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01326  site-specific recombinase, phage integrase family  26.35 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0890687  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0555  hypothetical protein  29.58 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178247  normal  0.46728 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  27.14 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  23.71 
 
 		 383 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  23.17 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  23.17 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  23.17 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04071  site-specific recombinase, phage integrase family  23.18 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0594853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  24.9 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  25.2 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  24.42 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0631  phage-related integrase  24.84 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  25.24 
 
 		 270 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  25.24 
 
 		 270 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1139  phage-related integrase  24.84 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1734  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  22.66 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  25.12 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  24.71 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  25.12 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  22.75 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  21.37 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  26.03 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.56 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  25.93 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  23.21 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1647  integrase domain protein SAM domain protein  22.82 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  24.82 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  21.58 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  29.35 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  23.25 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  22.44 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  24.5 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  26.14 
 
 		 456 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  24.5 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  26.14 
 
 		 451 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  24.5 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  24.5 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  26.14 
 
 		 451 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  26.14 
 
 		 451 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  32.03 
 
 		 182 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  25.51 
 
 		 399 aa  53.1  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  24.07 
 
 		 341 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  20.99 
 
 		 284 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 412 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  22.17 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  25.79 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  23.4 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  21.66 
 
 		 412 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  25.81 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  23.85 
 
 		 413 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  23.7 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  26.09 
 
 		 294 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  23.55 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  23.99 
 
 		 334 aa  50.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1375  phage integrase family protein  27.67 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 368 aa  50.1  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0194  tyrosine recombinase XerC subunit  35.44 
 
 		 295 aa  49.7  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  20.39 
 
 		 368 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>