83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2161 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  100 
 
 
297 aa  608  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  72.3 
 
 
343 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  42.96 
 
 
361 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  39.51 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  40.43 
 
 
363 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  40.43 
 
 
296 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  29.47 
 
 
405 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  30.18 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  29.13 
 
 
367 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  30.34 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  29.82 
 
 
344 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  32.89 
 
 
426 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  30.28 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  28.7 
 
 
389 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  33.05 
 
 
359 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  29.69 
 
 
375 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  31.58 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  28.82 
 
 
346 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  28.42 
 
 
362 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  27.68 
 
 
385 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  26.62 
 
 
344 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  27.66 
 
 
250 aa  90.5  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  27.8 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  27.89 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  34.78 
 
 
125 aa  65.1  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  32.81 
 
 
164 aa  65.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  25.1 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  26.7 
 
 
361 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  27.36 
 
 
341 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  27.5 
 
 
335 aa  62.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  24.48 
 
 
382 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  23.38 
 
 
360 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  25.59 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  28.8 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  26.09 
 
 
307 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  27.85 
 
 
285 aa  55.8  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  27.08 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  23.98 
 
 
359 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  23.16 
 
 
335 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.67 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  23.46 
 
 
421 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  31.36 
 
 
638 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  24.42 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  29.45 
 
 
429 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  23.68 
 
 
351 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  26.85 
 
 
388 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  26.46 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  33.78 
 
 
378 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  21.33 
 
 
391 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  21.53 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  29.05 
 
 
332 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  26.26 
 
 
419 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.89 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  26.05 
 
 
286 aa  46.2  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  22.26 
 
 
310 aa  46.6  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  25.22 
 
 
295 aa  46.2  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  24.39 
 
 
295 aa  45.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  24.39 
 
 
295 aa  45.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0585  integrase family protein  24.46 
 
 
251 aa  45.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  21.2 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  27.85 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0569  integrase family protein  25.9 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0286562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  26.17 
 
 
422 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  25.94 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  20.77 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0989  integrase family protein  24.04 
 
 
355 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000138199  hitchhiker  0.00000000000000368709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3447  integrase family protein  31.86 
 
 
324 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  26.09 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  23.7 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  21.46 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  25.3 
 
 
298 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  25.57 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  22.12 
 
 
402 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1508  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.24 
 
 
319 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  23.97 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  22.55 
 
 
337 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  27.15 
 
 
311 aa  43.1  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  22.29 
 
 
414 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  26.29 
 
 
325 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  22.69 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  26.8 
 
 
336 aa  42.4  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  24.69 
 
 
393 aa  42.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1127  phage integrase  20.87 
 
 
301 aa  42.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>