181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1428 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 
125 aa  253  5e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  97.6 
 
 
164 aa  247  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  42.62 
 
 
382 aa  93.6  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  42.45 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  36.44 
 
 
367 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  38.39 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  39.62 
 
 
361 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  40.82 
 
 
359 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  38.74 
 
 
370 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  37.93 
 
 
405 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  35.48 
 
 
294 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  35.48 
 
 
362 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  34.78 
 
 
297 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  36.94 
 
 
370 aa  63.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  33.33 
 
 
335 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  33.33 
 
 
343 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  31.62 
 
 
389 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  32.56 
 
 
351 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  35.78 
 
 
389 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  29.73 
 
 
357 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  38.14 
 
 
296 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  38.14 
 
 
363 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  31.78 
 
 
335 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  38.53 
 
 
359 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  32.63 
 
 
270 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  27.73 
 
 
333 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  31.48 
 
 
375 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 
347 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  29.35 
 
 
344 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  30.43 
 
 
197 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  32.98 
 
 
349 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  30 
 
 
307 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  31.78 
 
 
353 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  33.33 
 
 
296 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 
324 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  28.18 
 
 
311 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  37.97 
 
 
363 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  26.42 
 
 
296 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  29.92 
 
 
360 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  31.51 
 
 
295 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  31.51 
 
 
295 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  29.51 
 
 
341 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  32.47 
 
 
304 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  31.19 
 
 
325 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  26.42 
 
 
299 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  29.92 
 
 
373 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  29.31 
 
 
250 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  27.36 
 
 
302 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  24.55 
 
 
310 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  29.87 
 
 
306 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  29.87 
 
 
306 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  34.4 
 
 
359 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  29.87 
 
 
306 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  29.87 
 
 
306 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  28.44 
 
 
344 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2477  integrase family protein  30.7 
 
 
330 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380932  normal  0.877994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  28.57 
 
 
310 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  24.53 
 
 
299 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0755  putative tyrosine recombinase  32.94 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313446  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  29.13 
 
 
360 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.67 
 
 
311 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  33.8 
 
 
324 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  30.38 
 
 
317 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  24.53 
 
 
299 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  24.53 
 
 
299 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3447  integrase family protein  29.2 
 
 
324 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  28.09 
 
 
295 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  23.58 
 
 
299 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 
310 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.77 
 
 
300 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  34.45 
 
 
348 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  26.76 
 
 
310 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 
300 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  24.32 
 
 
302 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  30.14 
 
 
304 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  29.63 
 
 
254 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  29.33 
 
 
296 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  28.75 
 
 
294 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 
313 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.76 
 
 
313 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 
301 aa  42.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  29.11 
 
 
306 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  28.95 
 
 
295 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.85 
 
 
296 aa  42  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.86 
 
 
299 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.86 
 
 
299 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2682  integrase family protein  31.82 
 
 
193 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.86 
 
 
299 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  25.22 
 
 
297 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  29 
 
 
324 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  29 
 
 
300 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  25.68 
 
 
299 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  27.52 
 
 
297 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  25.45 
 
 
299 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  28.91 
 
 
367 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2334  phage integrase family protein  45.45 
 
 
322 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113164 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0753  tyrosine recombinase XerD subunit  26.32 
 
 
297 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000038176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  32.1 
 
 
317 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  30.69 
 
 
320 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.85 
 
 
296 aa  42  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>