39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0755 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0755  putative tyrosine recombinase  100 
 
 		 101 aa  205  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313446  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  97.92 
 
 		 341 aa  192  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  47.78 
 
 		 359 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  48.24 
 
 		 348 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  38.37 
 
 		 370 aa  60.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  40.24 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  39.02 
 
 		 405 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  37.11 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  44 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  40.79 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  39.53 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  37.21 
 
 		 344 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  37.5 
 
 		 426 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  32.53 
 
 		 375 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  42.53 
 
 		 359 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 389 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  33.75 
 
 		 299 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  33.78 
 
 		 331 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  32.93 
 
 		 361 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  42.86 
 
 		 359 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  32.94 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  35.05 
 
 		 313 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  36.36 
 
 		 328 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  32.94 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  37.18 
 
 		 292 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.44 
 
 		 345 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  30.34 
 
 		 357 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.75 
 
 		 325 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.38 
 
 		 321 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1492  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  34.33 
 
 		 320 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1475  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  34.33 
 
 		 320 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.04346  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4608  site-specific recombinase, phage integrase family  34.33 
 
 		 320 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  41.27 
 
 		 363 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  31.58 
 
 		 349 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  35.44 
 
 		 295 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  34.21 
 
 		 295 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  28.81 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0180  phage integrase  32.69 
 
 		 336 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0996549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>