55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3065 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  100 
 
 		 361 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  78.79 
 
 		 363 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  80.74 
 
 		 296 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  54.14 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  42.81 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  37.04 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  31.95 
 
 		 405 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  31.15 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  35.96 
 
 		 367 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  30.22 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  33.33 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  34.96 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  31.58 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  30.35 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  34.39 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  33.64 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  30.48 
 
 		 344 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  29.53 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  33.78 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  28.8 
 
 		 346 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  25.53 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  31.25 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  35.83 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  40 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  29.46 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  31.02 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  24.75 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  29.23 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  27.09 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  26.91 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  29.14 
 
 		 197 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.23 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  29.15 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  27.16 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  29.21 
 
 		 359 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  38.36 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  24.04 
 
 		 487 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0755  putative tyrosine recombinase  30.34 
 
 		 101 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313446  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  20.44 
 
 		 376 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  23.95 
 
 		 644 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  26.3 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 286 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  24.78 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  21.15 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.79 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  20.79 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  21.72 
 
 		 288 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  26.56 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  24.36 
 
 		 643 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0569  integrase family protein  25.35 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0286562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  29.27 
 
 		 638 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  22.49 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1213  phage integrase family protein  22.31 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550435  normal  0.724829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  25.2 
 
 		 450 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>