58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0619 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  100 
 
 
389 aa  790    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  40.24 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  35.53 
 
 
426 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  40.59 
 
 
344 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  39.44 
 
 
375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  37.34 
 
 
370 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  36.93 
 
 
370 aa  143  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  41.28 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  33.88 
 
 
405 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  35.77 
 
 
294 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  36.91 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  35.77 
 
 
362 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  37.14 
 
 
359 aa  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  32.47 
 
 
389 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  40.35 
 
 
385 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  30.17 
 
 
343 aa  99.4  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  28.7 
 
 
297 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  35.09 
 
 
346 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  32.86 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  29.71 
 
 
250 aa  90.5  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  29.52 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  31.8 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  29.13 
 
 
357 aa  86.7  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  29.61 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  35.24 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  35.24 
 
 
296 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  31.77 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  29.69 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  29.83 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  27.8 
 
 
360 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  27.41 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  26.13 
 
 
335 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  31.62 
 
 
164 aa  61.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  31.62 
 
 
125 aa  61.6  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  28.57 
 
 
349 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  25.24 
 
 
346 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  30.46 
 
 
197 aa  57  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  27.43 
 
 
333 aa  56.2  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  27.35 
 
 
361 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  22.38 
 
 
326 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  23.63 
 
 
402 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  26.03 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  26.25 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  27.08 
 
 
349 aa  49.7  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  35.37 
 
 
189 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.16 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  24.43 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  29.26 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  37.14 
 
 
189 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  26.26 
 
 
189 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0755  putative tyrosine recombinase  33.33 
 
 
101 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313446  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  22.53 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.5 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  21.5 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3447  integrase family protein  29.1 
 
 
324 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22 
 
 
376 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  27.27 
 
 
193 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.89 
 
 
324 aa  42.7  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>