84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1790 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  100 
 
 		 361 aa  748    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  30.25 
 
 		 359 aa  106  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  28.41 
 
 		 382 aa  99.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  28.49 
 
 		 344 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  29.51 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  27.43 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  29.55 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  28.36 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  24.75 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  27.32 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  28.66 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  29.78 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  28.21 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  31.21 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  27.74 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  30.22 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  27.27 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  25.22 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  23.86 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  28.12 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  24.21 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  23.05 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  28.87 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  23.89 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  25.32 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  31.28 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  26.95 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  27.76 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  21.02 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  24.25 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  27.9 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  24.45 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  32.17 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  26.7 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  25.23 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  26.58 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  26.6 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  30.05 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  30.05 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  23.21 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  22.36 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  26.49 
 
 		 383 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 361 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.02 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  25.27 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  23.23 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  22.75 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  23.23 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  23.4 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.02 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  27.35 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  25.82 
 
 		 251 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  25.75 
 
 		 349 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  25.65 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  25.82 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  25.45 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  23.34 
 
 		 342 aa  49.7  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  25.18 
 
 		 381 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  25 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  25.15 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0430  site-specific recombinase XerD-like  28 
 
 		 291 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00678047  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.62 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  23.44 
 
 		 324 aa  46.6  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  26.07 
 
 		 311 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  24.78 
 
 		 368 aa  46.2  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  24.56 
 
 		 343 aa  46.2  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  32.54 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  27.88 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  25.1 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  40.43 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  40.43 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  40.43 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  40.43 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  40.43 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  29.13 
 
 		 164 aa  43.9  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  26.87 
 
 		 358 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.31 
 
 		 376 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  32.99 
 
 		 372 aa  42.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>