216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1474 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  97.6 
 
 		 125 aa  247  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  36.54 
 
 		 382 aa  94.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  41.82 
 
 		 426 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  36.07 
 
 		 367 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  36.36 
 
 		 359 aa  77.4  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  37.04 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  36.94 
 
 		 361 aa  71.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  38.74 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  35.66 
 
 		 405 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  32.81 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  36.94 
 
 		 370 aa  64.3  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  34.68 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  34.4 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  31.25 
 
 		 343 aa  61.6  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  31.62 
 
 		 389 aa  61.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 335 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  36.04 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  29.22 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  35.78 
 
 		 389 aa  58.2  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  36.04 
 
 		 363 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  30.22 
 
 		 335 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  29.5 
 
 		 351 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 357 aa  57.4  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  31.75 
 
 		 349 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  37.76 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  29.84 
 
 		 344 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  30.28 
 
 		 270 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.37 
 
 		 324 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  26.14 
 
 		 333 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 375 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 		 347 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  28.47 
 
 		 197 aa  51.2  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  29.56 
 
 		 373 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  28.18 
 
 		 311 aa  49.7  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  24.38 
 
 		 301 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  33.33 
 
 		 296 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 360 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  26.36 
 
 		 299 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  27.07 
 
 		 295 aa  48.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  27.07 
 
 		 295 aa  48.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  28.47 
 
 		 341 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  24.81 
 
 		 299 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  24.81 
 
 		 299 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  24.81 
 
 		 299 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  28.93 
 
 		 360 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  30.56 
 
 		 353 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  26.45 
 
 		 296 aa  47.8  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  36.71 
 
 		 363 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  26.96 
 
 		 302 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.97 
 
 		 385 aa  47.4  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2682  integrase family protein  30 
 
 		 193 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  24.55 
 
 		 310 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.55 
 
 		 376 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  25.64 
 
 		 250 aa  47  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  31.19 
 
 		 325 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  29.87 
 
 		 306 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  32.47 
 
 		 304 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  28.48 
 
 		 392 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  31.21 
 
 		 359 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 		 306 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  29.87 
 
 		 306 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.7 
 
 		 296 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  29.87 
 
 		 306 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  32.21 
 
 		 381 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 304 aa  45.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2477  integrase family protein  30.7 
 
 		 330 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380932  normal  0.877994 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  25.43 
 
 		 506 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.67 
 
 		 311 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  31.03 
 
 		 344 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  25.23 
 
 		 302 aa  44.7  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  24.66 
 
 		 386 aa  44.7  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  29.01 
 
 		 254 aa  44.7  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  27.14 
 
 		 397 aa  44.3  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  26.12 
 
 		 295 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  23.58 
 
 		 299 aa  44.3  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  25.17 
 
 		 304 aa  44.3  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  29.84 
 
 		 349 aa  44.3  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 		 310 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 		 301 aa  43.9  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 		 313 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  31.13 
 
 		 324 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 296 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.23 
 
 		 400 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 296 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0218  integrase family protein  28.7 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0399465 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  26.32 
 
 		 310 aa  43.5  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 		 300 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  28.75 
 
 		 294 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 296 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  30.99 
 
 		 310 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0753  tyrosine recombinase XerD subunit  26.21 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000038176  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  29.13 
 
 		 361 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 296 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  28 
 
 		 311 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0755  putative tyrosine recombinase  32.94 
 
 		 101 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313446  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.76 
 
 		 313 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>