More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1317 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  100 
 
 
325 aa  633  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  75.21 
 
 
363 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  55.87 
 
 
312 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  52.65 
 
 
317 aa  309  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  56.93 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  50.15 
 
 
329 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.57 
 
 
300 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.57 
 
 
300 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.07 
 
 
319 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.57 
 
 
300 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  52.32 
 
 
292 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2102  integrase family protein  57.43 
 
 
304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.75 
 
 
300 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  51.44 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  50.33 
 
 
295 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  55.3 
 
 
303 aa  272  7e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  55.88 
 
 
344 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  54.93 
 
 
298 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  54.1 
 
 
380 aa  266  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3995  integrase family protein  57.19 
 
 
311 aa  262  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  51.89 
 
 
325 aa  262  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  47.73 
 
 
336 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  53.77 
 
 
298 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  48.84 
 
 
310 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  53.47 
 
 
289 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.77 
 
 
355 aa  250  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3583  phage integrase  53.44 
 
 
385 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  47.96 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  48.8 
 
 
336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  49.69 
 
 
346 aa  242  6e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  50.99 
 
 
308 aa  241  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.94 
 
 
322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1178  integrase family protein  51.6 
 
 
329 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  39.35 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  46.18 
 
 
333 aa  209  5e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  41.1 
 
 
302 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  39.62 
 
 
294 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1525  integrase family protein  44.48 
 
 
327 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206219  hitchhiker  0.00883097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  40.68 
 
 
317 aa  205  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  36.84 
 
 
313 aa  204  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  35.92 
 
 
298 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.17 
 
 
296 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.84 
 
 
296 aa  202  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.84 
 
 
296 aa  202  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.84 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.84 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.84 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.84 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.84 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.84 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.84 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.84 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  40.65 
 
 
298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  39.1 
 
 
305 aa  198  9e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.72 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  34.63 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.72 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  34.63 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  34.95 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  33.76 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.58 
 
 
301 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.13 
 
 
299 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  37.82 
 
 
305 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.72 
 
 
299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  37.46 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  36.72 
 
 
296 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.39 
 
 
299 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.39 
 
 
299 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.39 
 
 
299 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.39 
 
 
299 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.39 
 
 
299 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  40.66 
 
 
293 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  39.16 
 
 
308 aa  194  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  43.73 
 
 
373 aa  193  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  38.22 
 
 
304 aa  193  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.07 
 
 
299 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  40.58 
 
 
294 aa  193  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  36.16 
 
 
302 aa  192  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  36.16 
 
 
302 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  34.1 
 
 
296 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  40.57 
 
 
324 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 
295 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  41.53 
 
 
317 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  40 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  35.83 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  41.64 
 
 
313 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  42.07 
 
 
302 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  33.99 
 
 
295 aa  188  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  37.5 
 
 
290 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  36.07 
 
 
295 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.41 
 
 
299 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  35.05 
 
 
296 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  38.91 
 
 
332 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.05 
 
 
300 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  39.81 
 
 
318 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  41.04 
 
 
294 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  40.26 
 
 
304 aa  186  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.86 
 
 
300 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  40.58 
 
 
302 aa  186  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  38.26 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>