124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0969 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  100 
 
 		 426 aa  865    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  63.22 
 
 		 367 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  45.93 
 
 		 370 aa  295  7e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  45.3 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  46.63 
 
 		 359 aa  265  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  43.21 
 
 		 405 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  40.31 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  39.57 
 
 		 344 aa  226  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  35.53 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  34.88 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  34.41 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  37.1 
 
 		 346 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  33.69 
 
 		 385 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  36.61 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  33.73 
 
 		 362 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  31.21 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  34.77 
 
 		 294 aa  136  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  33.45 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  32.89 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  34.42 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  31.63 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  35.34 
 
 		 250 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  33.95 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  33.95 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  30.52 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  33.06 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  28.16 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  41.82 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  41.82 
 
 		 164 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  26.76 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  31.79 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  25.57 
 
 		 349 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  31.28 
 
 		 361 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  24.92 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  23.61 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  24.2 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  22.22 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  24.1 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  25.36 
 
 		 383 aa  57  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  26.04 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  26.19 
 
 		 343 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  27.96 
 
 		 342 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 367 aa  53.9  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  26.19 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  22.01 
 
 		 311 aa  53.5  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0755  putative tyrosine recombinase  37.5 
 
 		 101 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313446  normal  0.431565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.83 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  27.99 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  23.72 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  23.66 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  25.83 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  25.11 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  23.93 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.83 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  25.46 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  28.48 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  27.69 
 
 		 332 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  26.09 
 
 		 288 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.46 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.77 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.46 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.46 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.46 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  28.48 
 
 		 340 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 300 aa  50.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  23.65 
 
 		 342 aa  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  28.9 
 
 		 189 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.87 
 
 		 303 aa  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  24.42 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.69 
 
 		 366 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  27.05 
 
 		 283 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.31 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.31 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.31 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.31 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.31 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0306  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.69 
 
 		 366 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  20.85 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1924  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.69 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.9 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  22.64 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1918  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.69 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.9 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.9 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  26.42 
 
 		 353 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  23.74 
 
 		 360 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  23.64 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  23.84 
 
 		 338 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  27.93 
 
 		 189 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  30.84 
 
 		 193 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  28.95 
 
 		 189 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  26 
 
 		 347 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.39 
 
 		 300 aa  47  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  27.69 
 
 		 336 aa  47  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1185  integrase family protein  23.53 
 
 		 311 aa  46.6  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  19.4 
 
 		 308 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  21.71 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  21.92 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>