159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1378 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  100 
 
 		 400 aa  820    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1229  hypothetical protein  40.63 
 
 		 406 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505856  normal  0.279847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  26.43 
 
 		 515 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  25.95 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  24.91 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  24.35 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  23.36 
 
 		 529 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  24.26 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  26.67 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  22.7 
 
 		 529 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  23.4 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0710  integrase family protein  23.4 
 
 		 324 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  24.81 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  23.88 
 
 		 599 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  22.33 
 
 		 538 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  21.88 
 
 		 304 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  24.55 
 
 		 463 aa  53.5  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  21.67 
 
 		 329 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  22.67 
 
 		 430 aa  53.1  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  22.88 
 
 		 687 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  25.06 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.35 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  24.17 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  24.61 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  25.46 
 
 		 302 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  23.51 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  24.34 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  25.46 
 
 		 302 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  24.34 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  26.4 
 
 		 242 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  23.9 
 
 		 310 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  30.21 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 297 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  22.73 
 
 		 300 aa  50.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  26.33 
 
 		 441 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  22.18 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  22.06 
 
 		 286 aa  49.7  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  23.44 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  24.76 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  21.43 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.76 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  25.34 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  29.84 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  26.29 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  24.24 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  23.81 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1885  phage integrase-like SAM-like  24.56 
 
 		 190 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.618174  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.14 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  25.34 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  24.76 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0498  phage integrase family protein  19.87 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000218969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  26.42 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  25.34 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  23.74 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  26.03 
 
 		 605 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  23.88 
 
 		 297 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0063  integrase family protein  23.45 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  21.1 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  27.99 
 
 		 426 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  24.06 
 
 		 527 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  25.17 
 
 		 567 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  21.9 
 
 		 331 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  21.9 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  21.01 
 
 		 301 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2399  site-specific recombinase, phage integrase family  24.34 
 
 		 332 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2031  integrase family protein  24.34 
 
 		 332 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0328  integrase family protein  24.34 
 
 		 332 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133269 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  39.02 
 
 		 692 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  23.66 
 
 		 367 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0833  site-specific recombinase, phage integrase family  24.34 
 
 		 332 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.7 
 
 		 310 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0667  integrase family protein  24.34 
 
 		 332 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.580243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0509  site-specific recombinase, phage integrase family  24.34 
 
 		 332 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  30.43 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  23.41 
 
 		 657 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  24.23 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  24.1 
 
 		 482 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  27.97 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  23.83 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  23.27 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  23.6 
 
 		 223 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  22.48 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  21.69 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  22.57 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.68 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0585  integrase family protein  26.09 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  27.91 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.97 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  22.64 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  24.82 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  26.03 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4048  integrase family protein  20.14 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.900099 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  24.81 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>