47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1229 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1229  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  837    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505856  normal  0.279847 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  40.63 
 
 		 400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  26.76 
 
 		 515 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  25.15 
 
 		 566 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  25.08 
 
 		 529 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  26.37 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  24.62 
 
 		 567 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0498  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000218969  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  25.1 
 
 		 605 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  23.55 
 
 		 599 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  29.77 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  29.77 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  29.77 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  21.58 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  26.03 
 
 		 538 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  22.61 
 
 		 297 aa  51.2  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  23.85 
 
 		 365 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  20.95 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  23.28 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0710  integrase family protein  22.68 
 
 		 324 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  28.81 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  21.67 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  21.38 
 
 		 566 aa  47.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  30.28 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  25.09 
 
 		 311 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  23.2 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  28.57 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  23.33 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  24.42 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1927  phage integrase family protein  24.36 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  27.54 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  22.3 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  24.66 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  24.02 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  22.88 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  29.47 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  29.47 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  31.09 
 
 		 255 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  29.47 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  24.83 
 
 		 587 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  23.62 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  25.48 
 
 		 563 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  21.27 
 
 		 563 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 582 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  26.82 
 
 		 301 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  24.49 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  20.9 
 
 		 327 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>