69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1078 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 414 aa  845    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  34.53 
 
 		 490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  29.86 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0788  Phage integrase  30.95 
 
 		 459 aa  106  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  30.23 
 
 		 458 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1310  hypothetical protein  26.59 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  28.52 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0192  integrase family protein  25.37 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1902  phage integrase  31.87 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183596  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  23.57 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  28.45 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1997  phage integrase  29.96 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.559264  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  33.57 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3521  phage integrase  28.47 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2329  phage integrase family protein  29.79 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0957732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  26.38 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  25.41 
 
 		 566 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3428  phage integrase protein  26.4 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6823  integrase family protein  33.13 
 
 		 358 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  25.71 
 
 		 533 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  25.48 
 
 		 581 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  27.09 
 
 		 605 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  24.79 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  26.1 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  31.33 
 
 		 657 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  30.43 
 
 		 646 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  32.88 
 
 		 159 aa  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  28.68 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  26.83 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  31.82 
 
 		 556 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  27.18 
 
 		 529 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  23.01 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  31.82 
 
 		 649 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1417  integrase  25.81 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  27.67 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  24.7 
 
 		 436 aa  47  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  24.72 
 
 		 334 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  22.78 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  26.02 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  31.37 
 
 		 172 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  22.89 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  22.89 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  25.19 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  25.43 
 
 		 568 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  28.38 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  24.66 
 
 		 508 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  24.66 
 
 		 508 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  31.39 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  27.22 
 
 		 563 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  25.79 
 
 		 618 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  29.93 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  28.77 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  25.53 
 
 		 692 aa  44.3  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2998  hypothetical protein  41.82 
 
 		 212 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  23.23 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3473  integrase family protein  34.09 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115261 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  24.06 
 
 		 302 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  23.23 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  21.96 
 
 		 472 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  25.65 
 
 		 359 aa  43.9  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  23.87 
 
 		 379 aa  43.9  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  25 
 
 		 509 aa  43.5  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  24.2 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.17 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  28.87 
 
 		 306 aa  43.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  25.26 
 
 		 412 aa  43.5  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  27.08 
 
 		 429 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>