100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4247 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  100 
 
 		 567 aa  1161    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  35.54 
 
 		 529 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  34.05 
 
 		 529 aa  236  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  30.42 
 
 		 538 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  29.05 
 
 		 515 aa  180  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  30.91 
 
 		 509 aa  169  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  28.47 
 
 		 563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  32.89 
 
 		 599 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  28.27 
 
 		 584 aa  141  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  31.38 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  29.3 
 
 		 560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  30.79 
 
 		 566 aa  117  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  29.34 
 
 		 441 aa  114  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  27.03 
 
 		 558 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 538 aa  104  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  28.62 
 
 		 310 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  28.85 
 
 		 441 aa  94  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  30.1 
 
 		 401 aa  94  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  25.27 
 
 		 687 aa  92.8  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  24.35 
 
 		 386 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  25.87 
 
 		 566 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  35.78 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  28.19 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  30.04 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  26.08 
 
 		 563 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  28.97 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  30 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  26.19 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  29.27 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  26.19 
 
 		 452 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  24.42 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  31.06 
 
 		 564 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  27.22 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  29.17 
 
 		 605 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  26.28 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  35.63 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  25.37 
 
 		 564 aa  70.5  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  30.65 
 
 		 556 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  28.57 
 
 		 602 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  24.8 
 
 		 635 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  30.65 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  26.67 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  26.59 
 
 		 581 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  27.21 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  32.54 
 
 		 550 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  26.65 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  24.71 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  30.93 
 
 		 559 aa  63.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  27.68 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  33.51 
 
 		 588 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  31.4 
 
 		 618 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  23.75 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  28.29 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  26.7 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  28.3 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  24.4 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  26.27 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  30.99 
 
 		 619 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  32.1 
 
 		 651 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  29.15 
 
 		 662 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  32 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  29.43 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  28.32 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  31.29 
 
 		 587 aa  57  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  25.74 
 
 		 508 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  25.74 
 
 		 508 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  27.93 
 
 		 540 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  24.44 
 
 		 588 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  31.15 
 
 		 602 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  33.58 
 
 		 616 aa  54.3  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.83 
 
 		 290 aa  53.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  22.82 
 
 		 294 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  25 
 
 		 527 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1229  hypothetical protein  24.12 
 
 		 406 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505856  normal  0.279847 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 568 aa  49.3  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  26.94 
 
 		 337 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  29.91 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  26.94 
 
 		 331 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  25.56 
 
 		 657 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  26.94 
 
 		 331 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  33.56 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  24.91 
 
 		 351 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  27.05 
 
 		 651 aa  48.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 582 aa  48.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  25.17 
 
 		 400 aa  47.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.73 
 
 		 282 aa  47.4  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  28.4 
 
 		 455 aa  47  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  26.56 
 
 		 548 aa  47  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  26.06 
 
 		 329 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.19 
 
 		 330 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4572  integrase family protein  22.4 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  40.28 
 
 		 549 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  23.62 
 
 		 388 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  24.71 
 
 		 351 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  24.62 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3682  hypothetical protein  29.87 
 
 		 486 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 292 aa  44.3  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  25.58 
 
 		 302 aa  43.9  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>