102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6546 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  905    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  41.91 
 
 		 566 aa  237  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  38.83 
 
 		 538 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  42.97 
 
 		 401 aa  186  9e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  33.04 
 
 		 687 aa  157  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  34.49 
 
 		 533 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  34.72 
 
 		 540 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  32.4 
 
 		 618 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  32.75 
 
 		 566 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  37.02 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  29.92 
 
 		 564 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  28.69 
 
 		 509 aa  130  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  31.85 
 
 		 588 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  32.3 
 
 		 452 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  32.3 
 
 		 412 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  35.24 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  28.46 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2524.1  hypothetical protein  49.25 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.547452  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  30.49 
 
 		 605 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  35.24 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  26.27 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  30.17 
 
 		 564 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  36.95 
 
 		 565 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  28.85 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  27.62 
 
 		 515 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  37.69 
 
 		 388 aa  108  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  27.36 
 
 		 529 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  30.94 
 
 		 602 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  29.2 
 
 		 581 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  29.77 
 
 		 563 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  29.78 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  32.3 
 
 		 602 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  33.68 
 
 		 646 aa  99.8  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  30.22 
 
 		 662 aa  99.8  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  27.7 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  27.55 
 
 		 529 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  33.18 
 
 		 588 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  33.51 
 
 		 556 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  33.51 
 
 		 649 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  27.46 
 
 		 529 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  28.32 
 
 		 635 aa  94  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  28.85 
 
 		 567 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  26.55 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  27.78 
 
 		 589 aa  92  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  26.07 
 
 		 548 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  29.64 
 
 		 559 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  26.58 
 
 		 593 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  30.85 
 
 		 550 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  27.7 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  25.25 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  30 
 
 		 616 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  29.27 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  29.27 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  29.27 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  28.4 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  27.12 
 
 		 599 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 568 aa  75.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  24.92 
 
 		 560 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  26.79 
 
 		 651 aa  73.6  0.000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  34.04 
 
 		 587 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  25.43 
 
 		 538 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  31.09 
 
 		 651 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  29.67 
 
 		 582 aa  70.5  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  33.13 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  23.61 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  30.32 
 
 		 619 aa  67  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  31.45 
 
 		 657 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  26.67 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  29.11 
 
 		 602 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  31.32 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  25.69 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  27.46 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  24.31 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  24.85 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  23.74 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  27.47 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  27.11 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  27.11 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  25.24 
 
 		 692 aa  56.6  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  29.38 
 
 		 692 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  22.51 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  23.53 
 
 		 584 aa  55.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  31.18 
 
 		 563 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  33.68 
 
 		 549 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  30.29 
 
 		 450 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3029  hypothetical protein  35.16 
 
 		 146 aa  53.5  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.355709  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  25.27 
 
 		 455 aa  53.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  27.1 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  23.4 
 
 		 490 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3682  hypothetical protein  37.08 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  30.82 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  22.62 
 
 		 527 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  22.29 
 
 		 451 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  29.05 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5393  integrase family protein  28.26 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  29.3 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2329  phage integrase family protein  25.32 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0957732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>