114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0462 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  100 
 
 		 439 aa  905    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  56.67 
 
 		 456 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  50.44 
 
 		 452 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  51.55 
 
 		 412 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  44.67 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  45.32 
 
 		 331 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  45.32 
 
 		 331 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  24.41 
 
 		 472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  34.81 
 
 		 401 aa  130  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  29.39 
 
 		 441 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  26.88 
 
 		 538 aa  117  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  26.99 
 
 		 566 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  28.63 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  27.18 
 
 		 533 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  33.33 
 
 		 564 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  28.87 
 
 		 515 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  30.91 
 
 		 565 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  32.9 
 
 		 646 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  41.33 
 
 		 556 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  29.15 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  29.46 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  40.67 
 
 		 649 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  24.92 
 
 		 430 aa  100  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  26.68 
 
 		 687 aa  99.8  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  27.7 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  23.31 
 
 		 434 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  32.44 
 
 		 529 aa  97.8  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  30.92 
 
 		 566 aa  97.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  28.57 
 
 		 687 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  25.95 
 
 		 386 aa  92.8  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  28.69 
 
 		 588 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  31.94 
 
 		 616 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  27.72 
 
 		 662 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  32.39 
 
 		 602 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  30.59 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 568 aa  83.6  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  32.39 
 
 		 564 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  27.97 
 
 		 529 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  25.27 
 
 		 588 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  25.35 
 
 		 529 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  25.56 
 
 		 538 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  34.95 
 
 		 540 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  27.71 
 
 		 605 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  32.65 
 
 		 550 aa  75.1  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  23.3 
 
 		 560 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  21.1 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  26.28 
 
 		 567 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  28.49 
 
 		 559 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  30.63 
 
 		 563 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  24.19 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  25.16 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  26.72 
 
 		 582 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  34.67 
 
 		 602 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  26.47 
 
 		 618 aa  71.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  29.86 
 
 		 587 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  29.63 
 
 		 619 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  30.73 
 
 		 651 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  23.97 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  24.41 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  23.06 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  21.92 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  28.77 
 
 		 581 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  26.81 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  29.66 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  25.55 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  25.78 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  27.44 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  30.1 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  29.63 
 
 		 692 aa  62.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  26.86 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  26.56 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  30.63 
 
 		 593 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  21.85 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  24.09 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  24.09 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  24.83 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  26.67 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  28.03 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  28.03 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  23.6 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  25.12 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  27.21 
 
 		 589 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  24.31 
 
 		 599 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 720 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  24.44 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  23.6 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  26.72 
 
 		 422 aa  57  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  26.76 
 
 		 482 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3682  hypothetical protein  30.53 
 
 		 486 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  25.36 
 
 		 692 aa  57  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  23.2 
 
 		 651 aa  57  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  21.18 
 
 		 563 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  27.35 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  23.66 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  25 
 
 		 635 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  25.31 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  21.4 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  28.72 
 
 		 549 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  22.49 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>