100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6399 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  100 
 
 		 509 aa  1039    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  46.76 
 
 		 588 aa  333  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  29.58 
 
 		 605 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  28.94 
 
 		 566 aa  182  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  33.96 
 
 		 550 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  30.65 
 
 		 593 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  28.77 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  30 
 
 		 581 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  33.13 
 
 		 388 aa  153  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  26.93 
 
 		 529 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  32.45 
 
 		 589 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  27.23 
 
 		 430 aa  147  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  27.27 
 
 		 563 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  31.94 
 
 		 662 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  24.91 
 
 		 687 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  30.39 
 
 		 568 aa  135  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  26.98 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  31.46 
 
 		 649 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  26.94 
 
 		 616 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  31.46 
 
 		 556 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  30.14 
 
 		 540 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  28.82 
 
 		 602 aa  130  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  28.69 
 
 		 441 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  27.07 
 
 		 618 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  25.64 
 
 		 565 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  28.15 
 
 		 386 aa  123  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  30.92 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  28.57 
 
 		 441 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  29.55 
 
 		 635 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  31.74 
 
 		 401 aa  116  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  25.77 
 
 		 559 aa  114  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  29.02 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  25.68 
 
 		 564 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  30.08 
 
 		 646 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  28.11 
 
 		 548 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  29.71 
 
 		 535 aa  110  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  31.2 
 
 		 498 aa  110  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  32.46 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  30.55 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  25.07 
 
 		 651 aa  101  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  30.49 
 
 		 588 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 499 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 538 aa  98.2  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  26.18 
 
 		 582 aa  97.1  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  27.49 
 
 		 560 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  27.37 
 
 		 566 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  29.53 
 
 		 651 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  28.27 
 
 		 472 aa  91.3  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  30.48 
 
 		 692 aa  90.9  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  25.27 
 
 		 602 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  24.67 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  26.5 
 
 		 564 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  27 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  28 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  24.42 
 
 		 567 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  27.03 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  26.64 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  27.55 
 
 		 657 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  30.15 
 
 		 602 aa  73.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  25.74 
 
 		 599 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  29.82 
 
 		 348 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  27.81 
 
 		 527 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  26.87 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  23.86 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  25.07 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  27.81 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  25.86 
 
 		 529 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 687 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  27.65 
 
 		 538 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  27.27 
 
 		 509 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  24.37 
 
 		 456 aa  67  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6808  hypothetical protein  77.27 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  27.64 
 
 		 549 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 720 aa  64.3  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  30.82 
 
 		 619 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  26.25 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  29.38 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  22.67 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  27.93 
 
 		 479 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  25.99 
 
 		 480 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  25.81 
 
 		 692 aa  52  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1429  integrase family protein  23.91 
 
 		 578 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  25.57 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  23.32 
 
 		 455 aa  50.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  24.72 
 
 		 584 aa  50.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  27.24 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  22.34 
 
 		 508 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  22.34 
 
 		 508 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  24.56 
 
 		 473 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  27.5 
 
 		 563 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  21.53 
 
 		 426 aa  47  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  22.49 
 
 		 431 aa  47  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  21.53 
 
 		 398 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  25 
 
 		 285 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  26.78 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.78 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2329  phage integrase family protein  28 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0957732  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  28.41 
 
 		 370 aa  43.9  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  25.43 
 
 		 391 aa  43.5  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>