82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4098 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  100 
 
 		 589 aa  1207    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  26.65 
 
 		 605 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  26.92 
 
 		 588 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  32.45 
 
 		 509 aa  148  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 593 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  28.8 
 
 		 563 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  25.76 
 
 		 550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  28.48 
 
 		 581 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  24.15 
 
 		 646 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  30 
 
 		 548 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  25.5 
 
 		 529 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  38.42 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  25.43 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  31.75 
 
 		 401 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  33.19 
 
 		 533 aa  97.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  27.17 
 
 		 535 aa  94.7  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  23.68 
 
 		 602 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  29.33 
 
 		 651 aa  94.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  27.12 
 
 		 662 aa  94.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  27.74 
 
 		 565 aa  94  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  26.61 
 
 		 498 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  26.55 
 
 		 566 aa  92.8  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  27.78 
 
 		 441 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  30.28 
 
 		 430 aa  90.5  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  23.91 
 
 		 635 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 499 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  23.88 
 
 		 430 aa  88.6  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  26.71 
 
 		 618 aa  88.2  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  32.18 
 
 		 556 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  32.18 
 
 		 649 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  26.88 
 
 		 616 aa  87  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  24.91 
 
 		 564 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  26.3 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  25.79 
 
 		 687 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  28.7 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  21.49 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  26.92 
 
 		 540 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  23.19 
 
 		 559 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  32.3 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  29.65 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  29.65 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  25.61 
 
 		 588 aa  74.7  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  22.55 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  25.78 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  23.64 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  30.77 
 
 		 619 aa  68.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  23.69 
 
 		 651 aa  67.8  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  30.26 
 
 		 560 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  25.95 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 582 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  24.77 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  28.92 
 
 		 657 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  26.05 
 
 		 568 aa  60.5  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  33.58 
 
 		 587 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  29.7 
 
 		 692 aa  59.7  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  27.21 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  22.3 
 
 		 564 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  24.05 
 
 		 602 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  23.05 
 
 		 692 aa  57.4  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  31.58 
 
 		 599 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  25.81 
 
 		 602 aa  57.4  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 720 aa  57.4  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  33.33 
 
 		 549 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  26.06 
 
 		 538 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  30.07 
 
 		 509 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 538 aa  54.3  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  24.19 
 
 		 431 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  24.19 
 
 		 426 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  27.66 
 
 		 527 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  24.19 
 
 		 398 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  29.76 
 
 		 529 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  27.7 
 
 		 455 aa  50.4  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  37.18 
 
 		 529 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  26.53 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  29.63 
 
 		 423 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  29.84 
 
 		 531 aa  47.4  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3682  hypothetical protein  34.94 
 
 		 486 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  23.2 
 
 		 508 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  23.2 
 
 		 508 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  26.24 
 
 		 412 aa  44.3  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  27.33 
 
 		 563 aa  44.3  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>