146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0349 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  100 
 
 		 560 aa  1142    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  34.94 
 
 		 515 aa  183  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  27.12 
 
 		 566 aa  153  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  29.61 
 
 		 538 aa  146  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  29.56 
 
 		 599 aa  131  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  30.25 
 
 		 567 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  25.69 
 
 		 618 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  28.27 
 
 		 529 aa  126  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  24.19 
 
 		 687 aa  125  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  27.2 
 
 		 529 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  32.99 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  30.66 
 
 		 424 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  27.82 
 
 		 533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  26.49 
 
 		 566 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  26.98 
 
 		 563 aa  109  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  31.4 
 
 		 441 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  31.6 
 
 		 401 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  29.7 
 
 		 558 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  27.49 
 
 		 509 aa  103  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  30.23 
 
 		 556 aa  103  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  30.23 
 
 		 649 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  30.08 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  30.65 
 
 		 386 aa  101  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  30.61 
 
 		 548 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  28.21 
 
 		 584 aa  98.6  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  31.76 
 
 		 529 aa  97.1  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  29.03 
 
 		 430 aa  95.9  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  29.88 
 
 		 646 aa  94  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  31.92 
 
 		 499 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  27.97 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  27.97 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  28.41 
 
 		 472 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  25.69 
 
 		 538 aa  88.2  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  29.32 
 
 		 616 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  26.25 
 
 		 635 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  30.77 
 
 		 564 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  27.38 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  30.84 
 
 		 565 aa  83.2  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  28.16 
 
 		 602 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  26.85 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  32.64 
 
 		 657 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  27.78 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  25.58 
 
 		 605 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  25.57 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  23.77 
 
 		 581 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  26.8 
 
 		 662 aa  80.5  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  29 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  24.71 
 
 		 550 aa  80.1  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  28.87 
 
 		 426 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  27.75 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  23.58 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  28.5 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  27.82 
 
 		 527 aa  76.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  28.51 
 
 		 619 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  24.64 
 
 		 588 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  26.86 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  29.74 
 
 		 589 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  26.27 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  23.71 
 
 		 568 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  25.97 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  26.34 
 
 		 587 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  27.1 
 
 		 531 aa  69.3  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  26.67 
 
 		 692 aa  68.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  27.71 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  22.63 
 
 		 564 aa  67.4  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  26.94 
 
 		 588 aa  67.4  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  31.79 
 
 		 559 aa  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  25.81 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  23.56 
 
 		 540 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  24.9 
 
 		 651 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  29.19 
 
 		 602 aa  64.3  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  26.75 
 
 		 398 aa  63.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  25.4 
 
 		 498 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  30.3 
 
 		 593 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  25.61 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  23.76 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  22.4 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  24.03 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 582 aa  57.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  25.35 
 
 		 348 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  24.63 
 
 		 473 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 		 302 aa  56.6  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  25.17 
 
 		 602 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  24.84 
 
 		 318 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  25.68 
 
 		 337 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  25.68 
 
 		 331 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  25.68 
 
 		 331 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  27.4 
 
 		 651 aa  55.1  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 372 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2347  phage integrase family protein  23.64 
 
 		 332 aa  53.5  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.01871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  21.68 
 
 		 458 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  26.6 
 
 		 692 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  23.75 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  23.87 
 
 		 295 aa  52.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  23.75 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  23.75 
 
 		 431 aa  52  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  23.31 
 
 		 317 aa  51.6  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  32.08 
 
 		 549 aa  51.2  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  28.06 
 
 		 371 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1223  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159042  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>