110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0646 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  100 
 
 		 456 aa  933    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  56.67 
 
 		 439 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  47.49 
 
 		 452 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  47.13 
 
 		 412 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  43.11 
 
 		 337 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  43.11 
 
 		 331 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  43.11 
 
 		 331 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  27.27 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  31.14 
 
 		 515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  27.7 
 
 		 441 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  28.62 
 
 		 566 aa  120  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  30.98 
 
 		 436 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  32.08 
 
 		 401 aa  116  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 538 aa  114  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  30.08 
 
 		 388 aa  109  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  28.85 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  29.43 
 
 		 533 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  25.73 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  25.84 
 
 		 687 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  31.53 
 
 		 386 aa  103  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  25.41 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  30.68 
 
 		 564 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  27.36 
 
 		 687 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  27.85 
 
 		 566 aa  98.2  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  29.1 
 
 		 529 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  30.7 
 
 		 529 aa  96.3  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  23.17 
 
 		 426 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  33.69 
 
 		 556 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  33.16 
 
 		 649 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  26.71 
 
 		 529 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  31.87 
 
 		 565 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  26.4 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  25.42 
 
 		 616 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  21.52 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  28.25 
 
 		 646 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  27.7 
 
 		 602 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  24.91 
 
 		 588 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  26.34 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  26.2 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  23.67 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  25.46 
 
 		 564 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  27.27 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  24.52 
 
 		 568 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  32.29 
 
 		 651 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  24.56 
 
 		 550 aa  73.2  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  25.17 
 
 		 358 aa  73.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  24.23 
 
 		 490 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  25.59 
 
 		 582 aa  71.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  25.44 
 
 		 587 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  22.62 
 
 		 581 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  23.22 
 
 		 618 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  31.72 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  25.08 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  27.21 
 
 		 567 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  25.09 
 
 		 538 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  25.31 
 
 		 605 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  24.37 
 
 		 509 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  27.16 
 
 		 662 aa  67  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  25.71 
 
 		 602 aa  66.6  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  27.51 
 
 		 559 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  26.09 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  34.83 
 
 		 692 aa  63.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  25.95 
 
 		 589 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  25.09 
 
 		 560 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  22.22 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  25.63 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  23.67 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  26.2 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  26.03 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 720 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  24.34 
 
 		 651 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  31.33 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  21.99 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  24.88 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  31.13 
 
 		 602 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  23.61 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  21.45 
 
 		 473 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  23.31 
 
 		 599 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  25.24 
 
 		 527 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  23.66 
 
 		 499 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  26.19 
 
 		 470 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  26.95 
 
 		 431 aa  53.9  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  28.93 
 
 		 450 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  21.89 
 
 		 563 aa  53.5  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  27.88 
 
 		 508 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  27.88 
 
 		 508 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  25.24 
 
 		 692 aa  51.2  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  21.83 
 
 		 635 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  25.14 
 
 		 657 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4608  site-specific recombinase, phage integrase family  22.07 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1475  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  22.07 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.04346  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  23.61 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  27.08 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.71 
 
 		 317 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  22.05 
 
 		 584 aa  47.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  26.57 
 
 		 310 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0788  Phage integrase  23.22 
 
 		 459 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0865  integrase family protein  29.93 
 
 		 353 aa  47  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  25.56 
 
 		 429 aa  47  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>