86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3526 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  100 
 
 		 559 aa  1158    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  33.33 
 
 		 565 aa  269  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  25.49 
 
 		 616 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  31.42 
 
 		 441 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  30.86 
 
 		 388 aa  121  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  27.67 
 
 		 509 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  27.25 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  27.25 
 
 		 649 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  26.95 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  25.51 
 
 		 602 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  24.39 
 
 		 538 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  23.82 
 
 		 563 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  26.63 
 
 		 430 aa  101  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  25.21 
 
 		 566 aa  100  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  27.38 
 
 		 386 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  23.65 
 
 		 646 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  28.66 
 
 		 566 aa  94.7  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  27.48 
 
 		 529 aa  92.8  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  25.44 
 
 		 564 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  21.71 
 
 		 618 aa  90.9  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  24.3 
 
 		 687 aa  90.5  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  27.38 
 
 		 581 aa  90.5  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  27.37 
 
 		 381 aa  90.1  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  29.64 
 
 		 441 aa  90.1  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  30.63 
 
 		 550 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  25 
 
 		 426 aa  88.6  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  38.46 
 
 		 588 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  23.98 
 
 		 509 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  28.62 
 
 		 602 aa  86.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  27.08 
 
 		 605 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  24.64 
 
 		 568 aa  82.8  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  25.58 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  29.56 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  31.22 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  28.49 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  22.47 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  28.49 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  26.09 
 
 		 548 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  28.08 
 
 		 515 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  23 
 
 		 589 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  27.6 
 
 		 587 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  23.95 
 
 		 662 aa  77.4  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  24.76 
 
 		 358 aa  76.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  24.88 
 
 		 619 aa  74.7  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  25.99 
 
 		 651 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  33.05 
 
 		 651 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  25.67 
 
 		 602 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  28.49 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  24.4 
 
 		 540 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  31.03 
 
 		 599 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  24.12 
 
 		 430 aa  67  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  32.24 
 
 		 538 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  23.1 
 
 		 593 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  25 
 
 		 563 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  29.41 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  27.51 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  43.68 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  22.83 
 
 		 582 aa  63.9  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  30.64 
 
 		 560 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  30.93 
 
 		 567 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  25.63 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  28.27 
 
 		 588 aa  63.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  24.59 
 
 		 564 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  30.23 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  23.77 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  22.78 
 
 		 635 aa  57  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  27.66 
 
 		 529 aa  57  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  33.14 
 
 		 310 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  31.93 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  26.63 
 
 		 657 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  26.44 
 
 		 558 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 720 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  27.33 
 
 		 472 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  24.06 
 
 		 687 aa  52.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  23.03 
 
 		 498 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  31.96 
 
 		 692 aa  48.5  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  25.88 
 
 		 348 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  21.1 
 
 		 386 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0865  integrase family protein  25.64 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2395  integrase family protein  25.99 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3029  hypothetical protein  29.85 
 
 		 146 aa  45.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.355709  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  30.93 
 
 		 549 aa  45.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  24.88 
 
 		 527 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  29.73 
 
 		 584 aa  44.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  22.98 
 
 		 391 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  25.44 
 
 		 692 aa  43.9  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>