106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4527 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 649 aa  1347    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  99.64 
 
 		 556 aa  1143    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  45.5 
 
 		 646 aa  581  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  30.63 
 
 		 662 aa  298  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  31.48 
 
 		 651 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  30.15 
 
 		 430 aa  146  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  30.86 
 
 		 436 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  31.35 
 
 		 388 aa  144  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  30.4 
 
 		 441 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  26.3 
 
 		 529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  27.89 
 
 		 563 aa  135  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  28.96 
 
 		 687 aa  133  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  31.46 
 
 		 509 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  31.71 
 
 		 566 aa  127  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  27.82 
 
 		 605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  27.37 
 
 		 434 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  30.94 
 
 		 564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  30.35 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  27.78 
 
 		 581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  39.46 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  31.33 
 
 		 565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  27.25 
 
 		 559 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 538 aa  111  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  23.97 
 
 		 616 aa  107  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  25.98 
 
 		 618 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  33.05 
 
 		 657 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  26.18 
 
 		 602 aa  106  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  23.5 
 
 		 588 aa  103  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  27.08 
 
 		 588 aa  103  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  37.85 
 
 		 692 aa  100  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  26.38 
 
 		 566 aa  100  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  32.97 
 
 		 533 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  40.67 
 
 		 439 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  28.36 
 
 		 550 aa  99.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  32.63 
 
 		 412 aa  97.8  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  32.63 
 
 		 452 aa  97.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  28.38 
 
 		 498 aa  95.9  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  29.23 
 
 		 593 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  33.51 
 
 		 441 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  30.23 
 
 		 560 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  28.72 
 
 		 540 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  32.83 
 
 		 720 aa  92.8  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  34.83 
 
 		 472 aa  91.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  28.02 
 
 		 386 aa  91.3  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  32.23 
 
 		 602 aa  90.9  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  33.16 
 
 		 456 aa  90.5  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  24.84 
 
 		 568 aa  88.6  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  29.94 
 
 		 548 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  32.18 
 
 		 589 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  26.3 
 
 		 564 aa  87  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  27.36 
 
 		 602 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  29.92 
 
 		 619 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  23.77 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  29.82 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  31.95 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  23.81 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  28.25 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  33.79 
 
 		 549 aa  76.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  28.69 
 
 		 348 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  30.89 
 
 		 692 aa  77  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  26.41 
 
 		 687 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  23.05 
 
 		 651 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  31.21 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  24.51 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  24.51 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  34.62 
 
 		 587 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  30.57 
 
 		 529 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  22.47 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  31.65 
 
 		 599 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  30.65 
 
 		 567 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1429  integrase family protein  25.14 
 
 		 578 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  23.49 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  32.37 
 
 		 582 aa  66.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  24.05 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  28.04 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  26.56 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3682  hypothetical protein  25.21 
 
 		 486 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  22.15 
 
 		 635 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  24.4 
 
 		 531 aa  55.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  28.1 
 
 		 310 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 482 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1997  phage integrase  30.64 
 
 		 422 aa  52  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.559264  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3521  phage integrase  30.64 
 
 		 422 aa  52  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  31.16 
 
 		 367 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3029  hypothetical protein  28.79 
 
 		 146 aa  50.8  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.355709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  29.93 
 
 		 490 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.21 
 
 		 376 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  23.81 
 
 		 538 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  25.6 
 
 		 404 aa  48.1  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  26.92 
 
 		 422 aa  47.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  31.82 
 
 		 414 aa  47.4  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  27.61 
 
 		 480 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.5 
 
 		 391 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  29.05 
 
 		 527 aa  46.6  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  25.62 
 
 		 558 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  25.29 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  25.14 
 
 		 563 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0192  integrase family protein  24.56 
 
 		 461 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  34.38 
 
 		 331 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>