116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1730 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  100 
 
 		 616 aa  1278    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  27.79 
 
 		 602 aa  171  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  29.63 
 
 		 441 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  30.32 
 
 		 388 aa  140  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  26.87 
 
 		 566 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  25.66 
 
 		 692 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  25.49 
 
 		 559 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  26.82 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  28.49 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  26.94 
 
 		 509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  30.83 
 
 		 646 aa  127  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  26.17 
 
 		 550 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  28.91 
 
 		 687 aa  124  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  29.38 
 
 		 381 aa  124  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  23.76 
 
 		 605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  25.25 
 
 		 662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  23.31 
 
 		 588 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  24.83 
 
 		 581 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 568 aa  117  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  26.5 
 
 		 386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  33.33 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  29.64 
 
 		 565 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  27.54 
 
 		 564 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 426 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  23.82 
 
 		 566 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  23.96 
 
 		 563 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  25.55 
 
 		 529 aa  111  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  23.97 
 
 		 649 aa  107  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  25.9 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  29.64 
 
 		 556 aa  103  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  34.22 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  24.73 
 
 		 593 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  23.78 
 
 		 531 aa  100  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  25.75 
 
 		 651 aa  99.4  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  25.56 
 
 		 540 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  28.88 
 
 		 618 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  34.72 
 
 		 401 aa  95.1  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  26.92 
 
 		 635 aa  94  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  26.85 
 
 		 651 aa  92  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  32.82 
 
 		 499 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  31.94 
 
 		 439 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  26.88 
 
 		 589 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  23.6 
 
 		 619 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  29.88 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  24.86 
 
 		 587 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  28.57 
 
 		 560 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  25.69 
 
 		 472 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  24.06 
 
 		 588 aa  83.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  31.22 
 
 		 602 aa  83.2  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  25.42 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  32.07 
 
 		 538 aa  81.3  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  30 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  24.41 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  25.33 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  25.55 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  23.13 
 
 		 564 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  29.41 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  22.65 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  25.3 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  27.8 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 582 aa  74.3  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  30.63 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  28.57 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  22.79 
 
 		 548 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  25.51 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  28.26 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 687 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  23.08 
 
 		 584 aa  65.1  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  29.63 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  21.29 
 
 		 657 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4097  integrase family protein  29.41 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  20.73 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  25.51 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  36.25 
 
 		 692 aa  60.8  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  25.93 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  28.37 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  32.2 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 482 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  29.19 
 
 		 538 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  33.58 
 
 		 567 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 295 aa  53.9  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  31.33 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  38.14 
 
 		 563 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  24.76 
 
 		 549 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  26.11 
 
 		 424 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  26.61 
 
 		 602 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2395  integrase family protein  30.69 
 
 		 456 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  24.79 
 
 		 372 aa  50.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  27.52 
 
 		 458 aa  50.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  29.45 
 
 		 422 aa  49.7  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1202  integrase family protein  23.43 
 
 		 346 aa  49.3  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  25.91 
 
 		 527 aa  48.5  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 372 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  26.04 
 
 		 288 aa  47.8  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  23.14 
 
 		 277 aa  47.4  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  25.63 
 
 		 441 aa  47.4  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  24.24 
 
 		 337 aa  47  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  24.24 
 
 		 331 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  25.55 
 
 		 508 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  25.55 
 
 		 508 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>