61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0023 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 
452 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  100 
 
 
331 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  99.7 
 
 
337 aa  664    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  99.65 
 
 
412 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  45.32 
 
 
439 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  43.11 
 
 
456 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  29.31 
 
 
472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  29.27 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  24.38 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  26.26 
 
 
566 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  35.86 
 
 
515 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  23.68 
 
 
687 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  28.81 
 
 
401 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  33.85 
 
 
564 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  26.87 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  32.64 
 
 
529 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  31.25 
 
 
529 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  27.69 
 
 
436 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  32.62 
 
 
540 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  28.99 
 
 
529 aa  59.3  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  27.34 
 
 
687 aa  59.7  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  28.65 
 
 
538 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  26.96 
 
 
441 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  27.7 
 
 
533 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  27.21 
 
 
424 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  23.71 
 
 
490 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  32.04 
 
 
430 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  33.8 
 
 
538 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  23.82 
 
 
426 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  28.08 
 
 
458 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  25.99 
 
 
560 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  22.58 
 
 
602 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  29.2 
 
 
386 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  27.33 
 
 
605 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  32.35 
 
 
588 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  29.41 
 
 
565 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  31.78 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  28.78 
 
 
566 aa  52.8  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  26.63 
 
 
473 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  26.21 
 
 
581 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  26.91 
 
 
567 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  29.53 
 
 
657 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  28.04 
 
 
563 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2336  hypothetical protein  28.19 
 
 
257 aa  49.7  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  21.36 
 
 
386 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  30.34 
 
 
602 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  35.94 
 
 
556 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  27.82 
 
 
388 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  26.21 
 
 
618 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  25.9 
 
 
455 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  28.08 
 
 
450 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  24.24 
 
 
616 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  30.61 
 
 
646 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  33.71 
 
 
564 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  34.38 
 
 
649 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  39.29 
 
 
479 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  22.22 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  24.87 
 
 
558 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  25.76 
 
 
368 aa  43.5  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  27.46 
 
 
550 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>