88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1344 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 358 aa  728    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3028  hypothetical protein  55.56 
 
 		 208 aa  152  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325591  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3029  hypothetical protein  57.14 
 
 		 146 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.355709  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  30.48 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  29.89 
 
 		 588 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  30.55 
 
 		 509 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  29.78 
 
 		 441 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  29.1 
 
 		 646 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  30.53 
 
 		 538 aa  93.2  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  33.9 
 
 		 430 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  29.71 
 
 		 605 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  29.22 
 
 		 581 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  28.62 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  29.63 
 
 		 687 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  29.13 
 
 		 550 aa  86.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  27.92 
 
 		 441 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  29.08 
 
 		 566 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  31.39 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  24.4 
 
 		 529 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  26.52 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  30.08 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  26.69 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  23.81 
 
 		 649 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  30.91 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  23.81 
 
 		 556 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  24.76 
 
 		 559 aa  76.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  25.41 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 593 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  25.17 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  23.97 
 
 		 662 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  28.51 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  27.71 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  25.16 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  28.11 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  26.86 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  25.89 
 
 		 602 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  28.8 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  27.5 
 
 		 618 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  23.93 
 
 		 635 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  26.42 
 
 		 529 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  26.46 
 
 		 616 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  25.41 
 
 		 563 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  27.13 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  25.5 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  25.25 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  25.28 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  28.33 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  25.4 
 
 		 535 aa  63.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  23.47 
 
 		 548 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  26.7 
 
 		 567 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  25 
 
 		 565 aa  59.3  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  25.32 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  27.35 
 
 		 651 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 568 aa  57  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  25.99 
 
 		 498 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  25.31 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  26.38 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 582 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  26.12 
 
 		 657 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  23.56 
 
 		 538 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  25 
 
 		 599 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  27.03 
 
 		 651 aa  53.5  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  31.78 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  31.78 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  26.83 
 
 		 602 aa  53.5  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  31.78 
 
 		 337 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  22.76 
 
 		 584 aa  53.1  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  28.39 
 
 		 588 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  25.28 
 
 		 527 aa  53.1  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  28.48 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  25.64 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  23.13 
 
 		 558 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  26.53 
 
 		 589 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  22.64 
 
 		 619 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  23.94 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  20.89 
 
 		 508 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  20.89 
 
 		 508 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  24.58 
 
 		 602 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  27.97 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  26.92 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  29.1 
 
 		 692 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  24.19 
 
 		 482 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  26.87 
 
 		 361 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  24.64 
 
 		 549 aa  43.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  26.95 
 
 		 490 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3682  hypothetical protein  22.11 
 
 		 486 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>