102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3951 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  974    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  27.27 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  28.7 
 
 		 452 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  24.41 
 
 		 439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  29.31 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  29.31 
 
 		 331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  29.31 
 
 		 331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  27.2 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  22.58 
 
 		 436 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  32.16 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  25.61 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  27.78 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  25.67 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  27.8 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  24.64 
 
 		 605 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  26.6 
 
 		 566 aa  99  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  27.97 
 
 		 538 aa  98.2  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  22.7 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  29.31 
 
 		 441 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  33.19 
 
 		 646 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  23.37 
 
 		 687 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  35.39 
 
 		 556 aa  94  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  29.57 
 
 		 499 aa  93.6  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  34.83 
 
 		 649 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  28.27 
 
 		 509 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  30.41 
 
 		 602 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  28.17 
 
 		 529 aa  90.9  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  29.63 
 
 		 564 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  23.33 
 
 		 581 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  27.52 
 
 		 588 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  25.94 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  27.27 
 
 		 560 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  25.69 
 
 		 616 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  35.03 
 
 		 651 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  23.48 
 
 		 564 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  25.73 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  23.4 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  28.4 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  25.57 
 
 		 565 aa  80.1  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  30 
 
 		 651 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  25.77 
 
 		 515 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  30.91 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  26.54 
 
 		 662 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  26.51 
 
 		 550 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  24.14 
 
 		 692 aa  76.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  25.43 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  22.98 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  22.68 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  26.86 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  25.39 
 
 		 582 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  21.88 
 
 		 568 aa  70.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  24.06 
 
 		 687 aa  70.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  30.88 
 
 		 527 aa  70.5  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  23.64 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  28.42 
 
 		 548 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  29.28 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  21.67 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  31.25 
 
 		 540 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  30.51 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  21.84 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  24.32 
 
 		 529 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  24.73 
 
 		 635 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  27.61 
 
 		 692 aa  63.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  23.83 
 
 		 589 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  24.83 
 
 		 288 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 593 aa  62  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  23.23 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  22.22 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  26.27 
 
 		 567 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  21.89 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  22.91 
 
 		 588 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4646  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  24.26 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  22.55 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  25 
 
 		 531 aa  56.6  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  22.91 
 
 		 538 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  23.49 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  29.75 
 
 		 602 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  26.97 
 
 		 348 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  27.67 
 
 		 602 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  19.59 
 
 		 482 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  29.41 
 
 		 563 aa  53.5  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  27.33 
 
 		 559 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  27.81 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  23.3 
 
 		 584 aa  51.6  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  24.34 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  32.77 
 
 		 619 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  23.17 
 
 		 285 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  26.9 
 
 		 587 aa  50.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1508  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  22.44 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  23.18 
 
 		 283 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3428  phage integrase protein  18.7 
 
 		 440 aa  47.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  30.59 
 
 		 549 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4608  site-specific recombinase, phage integrase family  23.55 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1475  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  23.55 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.04346  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  22.05 
 
 		 599 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  21.6 
 
 		 310 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  24.88 
 
 		 405 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  21.96 
 
 		 414 aa  44.3  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3553  phage integrase  21.76 
 
 		 392 aa  44.3  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.631113  normal  0.139012 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  25.73 
 
 		 398 aa  43.9  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>