131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003902 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003902  integrase  100 
 
 
566 aa  1174    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  32.42 
 
 
564 aa  220  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  29.36 
 
 
566 aa  179  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  26.91 
 
 
602 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  33.23 
 
 
687 aa  157  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  27.34 
 
 
509 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  25.7 
 
 
588 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  27.48 
 
 
515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  36.4 
 
 
401 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  32.75 
 
 
441 aa  136  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  25.88 
 
 
618 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  26.04 
 
 
605 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  26.64 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  34.08 
 
 
529 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  31.44 
 
 
436 aa  127  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  27.06 
 
 
588 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  26.4 
 
 
599 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  30.38 
 
 
662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  33.22 
 
 
538 aa  121  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  33.11 
 
 
388 aa  121  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  33.71 
 
 
538 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  35.98 
 
 
441 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  24.87 
 
 
563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  28.47 
 
 
581 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  29.93 
 
 
434 aa  114  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  26.42 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  30.07 
 
 
558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  25.09 
 
 
550 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  24.32 
 
 
602 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  28.38 
 
 
498 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  29.47 
 
 
533 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  26.24 
 
 
584 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  29.29 
 
 
565 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  23.58 
 
 
616 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  26.01 
 
 
560 aa  107  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  22.36 
 
 
540 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  28.67 
 
 
582 aa  104  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  28.3 
 
 
535 aa  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  28.3 
 
 
424 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  28.91 
 
 
386 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  26.38 
 
 
556 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  28.94 
 
 
651 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  26.38 
 
 
649 aa  100  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  24.36 
 
 
646 aa  100  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  25.83 
 
 
548 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  23.21 
 
 
635 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  29.03 
 
 
529 aa  98.6  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  27.85 
 
 
456 aa  98.2  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  30.92 
 
 
439 aa  97.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  33.2 
 
 
441 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  28.66 
 
 
559 aa  94.7  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  27.37 
 
 
509 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  26.55 
 
 
589 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  27.05 
 
 
426 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  28.71 
 
 
381 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  33.85 
 
 
310 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  21.82 
 
 
593 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  25.87 
 
 
567 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  29.08 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  22.77 
 
 
531 aa  85.5  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  25.94 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  29.63 
 
 
720 aa  81.6  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  26.61 
 
 
657 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  29.91 
 
 
412 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  29.91 
 
 
452 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  22.52 
 
 
651 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  25.95 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  23.43 
 
 
564 aa  76.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  27.57 
 
 
499 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  25.35 
 
 
568 aa  76.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  27.45 
 
 
563 aa  76.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  28.78 
 
 
619 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  31.79 
 
 
692 aa  73.6  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2561  phage integrase  27.27 
 
 
458 aa  73.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190993  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  24.43 
 
 
508 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  24.43 
 
 
508 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  25.67 
 
 
587 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  27.27 
 
 
527 aa  71.2  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  25.14 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  27.2 
 
 
482 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  26.89 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  25.17 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  30.1 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  32.75 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3682  hypothetical protein  27.83 
 
 
486 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  28.18 
 
 
422 aa  64.3  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  28.88 
 
 
602 aa  64.3  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  30.91 
 
 
549 aa  63.9  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0788  Phage integrase  28.33 
 
 
459 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  27.49 
 
 
451 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  25.41 
 
 
414 aa  62  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1229  hypothetical protein  25.76 
 
 
406 aa  62  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505856  normal  0.279847 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  28.72 
 
 
687 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  24.32 
 
 
692 aa  60.8  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  25.74 
 
 
473 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  24.41 
 
 
490 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  26.2 
 
 
432 aa  54.3  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  28.78 
 
 
337 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  28.78 
 
 
331 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  28.78 
 
 
331 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>