111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3428 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  100 
 
 		 646 aa  1336    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  45.5 
 
 		 649 aa  581  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  43.57 
 
 		 556 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  30.58 
 
 		 662 aa  296  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  31.82 
 
 		 651 aa  290  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  31.67 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  31.35 
 
 		 434 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  30.61 
 
 		 436 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  30.23 
 
 		 441 aa  137  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  32.16 
 
 		 388 aa  129  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  30.83 
 
 		 616 aa  127  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  27.62 
 
 		 687 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  28.44 
 
 		 529 aa  123  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  28.16 
 
 		 588 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  42.51 
 
 		 426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  31.01 
 
 		 565 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  27.66 
 
 		 563 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  24.15 
 
 		 589 aa  114  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  27.81 
 
 		 588 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  27.38 
 
 		 538 aa  112  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  30.46 
 
 		 540 aa  112  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  33.33 
 
 		 401 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  30.08 
 
 		 509 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  35.75 
 
 		 602 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  28.17 
 
 		 386 aa  110  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  26.69 
 
 		 605 aa  106  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  26.85 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  32.9 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  26.79 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  28.38 
 
 		 550 aa  102  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  28.15 
 
 		 602 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 593 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  24.36 
 
 		 566 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  33.68 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  28.33 
 
 		 566 aa  99  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  29.1 
 
 		 358 aa  97.8  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  27.36 
 
 		 535 aa  97.8  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  33.19 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  26.3 
 
 		 564 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  30.55 
 
 		 412 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  30.55 
 
 		 452 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  31.13 
 
 		 657 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  23.65 
 
 		 559 aa  94.7  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  25.74 
 
 		 564 aa  95.1  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  27.06 
 
 		 651 aa  92.8  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  28.51 
 
 		 533 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  24.92 
 
 		 618 aa  92  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  25.8 
 
 		 582 aa  90.5  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  30.4 
 
 		 619 aa  89.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  26.69 
 
 		 498 aa  88.6  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  24.16 
 
 		 548 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  29.6 
 
 		 560 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 568 aa  88.2  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  33.7 
 
 		 692 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  27.66 
 
 		 348 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  28.79 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  36.48 
 
 		 587 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  28.25 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  31.65 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  20.67 
 
 		 692 aa  77  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  32.94 
 
 		 720 aa  76.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  29.91 
 
 		 386 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  30.11 
 
 		 602 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  21.88 
 
 		 635 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  32.93 
 
 		 529 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  27.61 
 
 		 538 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  22.19 
 
 		 515 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  33.54 
 
 		 529 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 687 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  28.93 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  22.7 
 
 		 549 aa  64.7  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  24.17 
 
 		 508 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  24.17 
 
 		 508 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  26.04 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2395  integrase family protein  30.77 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  33.96 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  28.3 
 
 		 567 aa  60.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  22.31 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  29.44 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  26.72 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  28.19 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  30.71 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4097  integrase family protein  27.14 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  22.63 
 
 		 599 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  25.38 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  28.66 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  28.93 
 
 		 310 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  25.62 
 
 		 584 aa  53.5  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  31.29 
 
 		 471 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  27.16 
 
 		 558 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  30.43 
 
 		 414 aa  51.2  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3029  hypothetical protein  32.65 
 
 		 146 aa  50.8  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.355709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  28.86 
 
 		 450 aa  50.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1429  integrase family protein  23.21 
 
 		 578 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  27.78 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  28.97 
 
 		 328 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  29.75 
 
 		 431 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  32.87 
 
 		 430 aa  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1223  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 402 aa  47.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  27.59 
 
 		 378 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>