143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1072 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  831    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  38.75 
 
 		 566 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  42.97 
 
 		 441 aa  186  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0438  phage integrase  37.29 
 
 		 533 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  35.79 
 
 		 618 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  33.89 
 
 		 538 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  36.74 
 
 		 687 aa  149  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  37.25 
 
 		 386 aa  145  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  36.64 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  36.4 
 
 		 566 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4261  hypothetical protein  38.74 
 
 		 564 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157557  hitchhiker  0.00000000178827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  34.81 
 
 		 439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4340  lambda integrase-like/DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  37.29 
 
 		 540 aa  130  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  32.44 
 
 		 588 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  38.73 
 
 		 581 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 588 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  32.24 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  32.24 
 
 		 452 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  31.74 
 
 		 509 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  32.08 
 
 		 456 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2130  phage integrase  33.05 
 
 		 563 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  39.46 
 
 		 556 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  39.46 
 
 		 649 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  33.33 
 
 		 646 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  31.48 
 
 		 605 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0818  integrase family protein  31.45 
 
 		 529 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  29.43 
 
 		 515 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  30.18 
 
 		 602 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  36.84 
 
 		 550 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  36.4 
 
 		 593 aa  106  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  33.98 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1478  integrase family protein  31.21 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  28.57 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  37.19 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  29.86 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  26.42 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1505  phage integrase family protein  32.69 
 
 		 582 aa  102  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0668751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0243  integrase family protein  30.45 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4098  integrase family protein  31.39 
 
 		 589 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0348  integrase family protein  27.51 
 
 		 635 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2367  integrase family protein  27.9 
 
 		 602 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.211693  normal  0.0605063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  27.8 
 
 		 472 aa  99.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0349  integrase family protein  30.37 
 
 		 560 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  31.01 
 
 		 568 aa  96.3  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  34.72 
 
 		 616 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  27.67 
 
 		 529 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4247  integrase family protein  30.1 
 
 		 567 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  30 
 
 		 651 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  31 
 
 		 662 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1302  Phage integrase  33.33 
 
 		 565 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.542121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1030  integrase family protein  28.17 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5385  integrase family protein  29.35 
 
 		 599 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1344  phage integrase family site specific recombinase  28.62 
 
 		 358 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  27.38 
 
 		 564 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  27.01 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3526  Phage integrase  29.56 
 
 		 559 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00532036  hitchhiker  0.00586759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  31.36 
 
 		 548 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  23.83 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  38.3 
 
 		 619 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0190  hypothetical protein  26.4 
 
 		 558 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43140  phage integrase-like protein  30.99 
 
 		 602 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  26.91 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3302  putative integrase  30.97 
 
 		 535 aa  76.6  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4249  phage integrase  34.01 
 
 		 587 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184605  hitchhiker  0.00000000381529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1029  integrase family protein  34.29 
 
 		 657 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0868  integrase family protein  30.66 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0699  phage integrase family protein  29.23 
 
 		 720 aa  73.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.976552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0284  phage integrase  28.57 
 
 		 563 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7504  integrase family protein  25.7 
 
 		 538 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4889  integrase family protein  31.03 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.467938  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4209  integrase domain-containing protein  31.95 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.50745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0048  phage integrase  29.75 
 
 		 692 aa  66.6  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.404651 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  28.81 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2410  putative phage-related integrase  28.81 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0023  hypothetical protein  28.81 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3313  phage integrase family protein  27.21 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  24.22 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0638  phage integrase family protein  32.48 
 
 		 687 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  40.28 
 
 		 89 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2183  integrase family protein  26.42 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.608923  hitchhiker  0.000529496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2942  integrase family protein  26.42 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0692889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0896  hypothetical protein  40.91 
 
 		 549 aa  60.1  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1411  hypothetical protein  27.44 
 
 		 527 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576963 
 
 
-
 
NC_004310  BR0256  phage integrase family site specific recombinase  23.1 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  25.1 
 
 		 651 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  29.52 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1653  phage integrase family protein  24.44 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000510818  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6823  integrase family protein  27.69 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0882  hypothetical protein  23.65 
 
 		 692 aa  57.4  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3521  phage integrase  27.93 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222857 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  37.14 
 
 		 89 aa  57  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3029  hypothetical protein  29.5 
 
 		 146 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.355709  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2329  phage integrase family protein  25.63 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0957732  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1997  phage integrase  27.62 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.559264  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  40.85 
 
 		 88 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0730  hypothetical protein  28.07 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4959  integrase family protein  27.11 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  38.03 
 
 		 90 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>