57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1017 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  183  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  79.55 
 
 
88 aa  157  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  78.41 
 
 
101 aa  153  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  65.91 
 
 
88 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1245  hypothetical protein  86.44 
 
 
59 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197075  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  52.81 
 
 
89 aa  104  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  54.02 
 
 
86 aa  100  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  47.19 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  47.19 
 
 
89 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  49.44 
 
 
89 aa  93.2  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  47.19 
 
 
89 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  51.14 
 
 
86 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  52.81 
 
 
94 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  47.13 
 
 
86 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  48.31 
 
 
89 aa  90.9  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  47.19 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  44.32 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  48.31 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  47.13 
 
 
86 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  50.57 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  47.73 
 
 
86 aa  84  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  52.05 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  47.22 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  51.47 
 
 
76 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  51.47 
 
 
76 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  43.82 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  49.43 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  45.24 
 
 
84 aa  77  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  39.77 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  49.32 
 
 
86 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  55.74 
 
 
74 aa  74.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  44.05 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  47.19 
 
 
86 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  46.07 
 
 
86 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  42.35 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  41.18 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  43.18 
 
 
88 aa  70.1  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  37.5 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1386  hypothetical protein  50.98 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  36.36 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  32.95 
 
 
89 aa  58.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2719  hypothetical protein  36.47 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  41.33 
 
 
72 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0673  hypothetical protein  47.06 
 
 
54 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4431  hypothetical protein  36.99 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.619358 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3444  hypothetical protein  44.58 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.935963 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  35.29 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  32.56 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  40.85 
 
 
401 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  30.14 
 
 
75 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  31.51 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1151  hypothetical protein  34.25 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1410  hypothetical protein  32.79 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0897  hypothetical protein  47.5 
 
 
50 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2035  hypothetical protein  29.49 
 
 
75 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1385  hypothetical protein  53.85 
 
 
53 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2604  hypothetical protein  26.92 
 
 
76 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>