46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0924 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  179  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  75.58 
 
 		 86 aa  142  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  49.43 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  47.67 
 
 		 86 aa  83.6  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  48.28 
 
 		 86 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  44.44 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  48.86 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  46.51 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  41.38 
 
 		 86 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  45.56 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  47.67 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  40.7 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  46.07 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  43.82 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  41.18 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  42.7 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  46.07 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  46.07 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  45.56 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  37.78 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  41.57 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  41.57 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  44.44 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  39.76 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  40.96 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  42.05 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  35.56 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  36.78 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  37.08 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  41.1 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  28.24 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  37.68 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  37.68 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0503  hypothetical protein  51.22 
 
 		 46 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0664  hypothetical protein  51.22 
 
 		 46 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  28.57 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1245  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1386  hypothetical protein  39.58 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02920  hypothetical protein  37.04 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00324963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  35.82 
 
 		 74 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  30.99 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  32.39 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  31.94 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>