45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1695 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  158  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  37.33 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  40.79 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  40.26 
 
 
86 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  40.54 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  37.5 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  35.21 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  37.33 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  39.73 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  57.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  34.29 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  35.21 
 
 
86 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4431  hypothetical protein  31.58 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.619358 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  32.43 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  36.49 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  38.57 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  31.94 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2719  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207392  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  36 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  38.98 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  32.88 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  36.62 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  28.95 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  32.88 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  31.94 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  35.14 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  34.25 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  31.51 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  28.38 
 
 
89 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  51.06 
 
 
74 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  32.86 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  33.78 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  31.08 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2604  hypothetical protein  28 
 
 
76 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55394  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  31.51 
 
 
89 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1151  hypothetical protein  30.26 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  32.39 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2035  hypothetical protein  25.68 
 
 
75 aa  43.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0950  hypothetical protein  28.77 
 
 
75 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1410  hypothetical protein  27.42 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  31.94 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  28.77 
 
 
88 aa  40  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02920  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00324963  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>