53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1098 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  181  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  62.35 
 
 
97 aa  115  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  59.52 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  53.49 
 
 
86 aa  98.2  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  48.1 
 
 
86 aa  87.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  46.75 
 
 
86 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  43.21 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  44.44 
 
 
89 aa  84  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  47.89 
 
 
86 aa  84  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  41.86 
 
 
86 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  46.84 
 
 
86 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  39.56 
 
 
94 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  49.32 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  42.05 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  40.7 
 
 
85 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  40.74 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0897  hypothetical protein  65.91 
 
 
50 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  40.23 
 
 
86 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  46.77 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  40.79 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  44.93 
 
 
72 aa  62  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  36.78 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  36.49 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  57.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  36.36 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  35.14 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  34.09 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  41.1 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  39.19 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  47.17 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  47.17 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  37.84 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  30.56 
 
 
75 aa  53.9  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  36.49 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2719  hypothetical protein  38.67 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207392  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1245  hypothetical protein  42.11 
 
 
59 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  38.36 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  34.25 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  37.33 
 
 
91 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1151  hypothetical protein  34.72 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  35.14 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  28.38 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  35.29 
 
 
85 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  37.33 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  34.94 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0503  hypothetical protein  48.89 
 
 
46 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0664  hypothetical protein  48.89 
 
 
46 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0673  hypothetical protein  54.05 
 
 
54 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3444  hypothetical protein  36.92 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.935963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  32.84 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1410  hypothetical protein  32.79 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  31.08 
 
 
88 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>