50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0264 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  186  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  96.47 
 
 
85 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  63.64 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  60.23 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  57.95 
 
 
89 aa  110  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  59.09 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  54.55 
 
 
89 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  53.41 
 
 
89 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  54.22 
 
 
84 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  56.18 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  53.41 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  50.56 
 
 
88 aa  90.1  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  48.31 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  46.59 
 
 
101 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  43.82 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  47.73 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  39.77 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  49.25 
 
 
76 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  49.25 
 
 
76 aa  71.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2719  hypothetical protein  40.24 
 
 
85 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1386  hypothetical protein  62 
 
 
64 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  41.76 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  39.33 
 
 
86 aa  67.4  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  41.57 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  44.74 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  39.77 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  31.46 
 
 
86 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  32.95 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  38.64 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  39.19 
 
 
103 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  41.89 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  36.59 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  35.96 
 
 
86 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  38.27 
 
 
86 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  41.1 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  37.84 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  35.37 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  38.03 
 
 
401 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  36.49 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  38.16 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  38.36 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  32.93 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  37.31 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  33.78 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1385  hypothetical protein  50 
 
 
53 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  30.49 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3444  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.935963 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1245  hypothetical protein  41.67 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02920  hypothetical protein  34.48 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00324963  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>