35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1245 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1245  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  86.44 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  69.49 
 
 		 88 aa  94.4  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  69.49 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  59.32 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  48.28 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  60.87 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  48.28 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  54.39 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  46.55 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  52.63 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  40.35 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  44.83 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  49.15 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  44.07 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  43.1 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  39.66 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  42.11 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  44.83 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  37.29 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  41.38 
 
 		 89 aa  50.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  37.93 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  41.38 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  43.1 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  36.21 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  39.66 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  41.38 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  48.28 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  36.21 
 
 		 86 aa  43.9  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  38.89 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  41.67 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  31.58 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  36.54 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0897  hypothetical protein  40 
 
 		 50 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>