44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0548 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  173  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  85.71 
 
 		 84 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  44.71 
 
 		 88 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  40.96 
 
 		 86 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  39.02 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  41.18 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  42.86 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  39.53 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  39.76 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  36.14 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  40.74 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  45.61 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  35.8 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  41.67 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  36.49 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  38.37 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  36.49 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1151  hypothetical protein  37.33 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  36.49 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2604  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  38.36 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1245  hypothetical protein  37.29 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  35.62 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  34.88 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  36.05 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  28.77 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  32.93 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  34.12 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  28.05 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1410  hypothetical protein  31.67 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0950  hypothetical protein  26.76 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  36.59 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4431  hypothetical protein  32 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.619358 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  32.31 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  32.31 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  34.92 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  30.23 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  30.99 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  29.73 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  30.59 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  34.57 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>