52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0239 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  181  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  52.33 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  52.33 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  51.76 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  48.84 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  45.88 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  45.88 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  44.71 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  43.02 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  45.45 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  41.38 
 
 		 86 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  40.91 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  40.91 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  45.45 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  40.23 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  39.77 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  40.91 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  40.91 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  38.37 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  39.77 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  36.36 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  36.36 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  39.53 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  38.36 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  36.36 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  32.95 
 
 		 89 aa  62  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  31.46 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  32.93 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  36.62 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  35.23 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1151  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  31.94 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2719  hypothetical protein  35.53 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  34.88 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  27.71 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0673  hypothetical protein  41.51 
 
 		 54 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  34.52 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  30.99 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  28.75 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  26.87 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  26.87 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0503  hypothetical protein  60 
 
 		 46 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0664  hypothetical protein  60 
 
 		 46 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1245  hypothetical protein  36.21 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1410  hypothetical protein  28.57 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  35.85 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1385  hypothetical protein  55.26 
 
 		 53 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>