42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0905 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  161  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  41.1 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  39.19 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  33.8 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  37.84 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  32.43 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  34.67 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  36.99 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  35.14 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  32.86 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  34.25 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  30.56 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  34.25 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  30.14 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  31.08 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  36.49 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  31.94 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  30 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  29.58 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  29.58 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  32 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1151  hypothetical protein  33.78 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  31.43 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  36.62 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  29.58 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  34.55 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  32.43 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  28.77 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  29.49 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  30.99 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  28.77 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  29.51 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  30 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  30 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  36.76 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  34.25 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  29.58 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  28.57 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1385  hypothetical protein  51.28 
 
 		 53 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  29.73 
 
 		 88 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1245  hypothetical protein  31.58 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197075  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  24.66 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>