53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1341 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  184  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  61.8 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  60.67 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  59.55 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  55.06 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  51.69 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  57.95 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  57.14 
 
 		 84 aa  110  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1386  hypothetical protein  98.11 
 
 		 64 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  52.81 
 
 		 89 aa  104  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  52.81 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  52.81 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  52.81 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  54.22 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  55.06 
 
 		 88 aa  98.6  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  53.93 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  51.14 
 
 		 86 aa  90.9  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1385  hypothetical protein  97.44 
 
 		 53 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  40.91 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  45.45 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  49.44 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  43.53 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  42.05 
 
 		 88 aa  76.6  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  44.32 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  48.86 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2719  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207392  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  40.91 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  44.44 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  42.05 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  40.91 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  44.74 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  44.74 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  39.33 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  41.57 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  44.32 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  40.91 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  40.91 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  41.1 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  39.02 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  41.46 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  35.63 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  38.37 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  40 
 
 		 401 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  39.74 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  35.14 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  37.21 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  32.43 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  37.33 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1245  hypothetical protein  41.38 
 
 		 59 aa  50.1  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197075  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4431  hypothetical protein  35.14 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.619358 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02920  hypothetical protein  34.78 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00324963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1410  hypothetical protein  29.03 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0673  hypothetical protein  36.54 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>