29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1151 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1151  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4431  hypothetical protein  41.56 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.619358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2035  hypothetical protein  39.19 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  38.03 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  39.44 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  40.28 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  38.67 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  34.72 
 
 
88 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  38.03 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  37.33 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1410  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  35.21 
 
 
82 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  35.06 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  34.67 
 
 
84 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  34.72 
 
 
86 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  32.39 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  33.78 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  33.8 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  34.25 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  34.25 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  29.58 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  37.68 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  31.94 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  30.26 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2604  hypothetical protein  34.29 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55394  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  32.88 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  34.29 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  30.14 
 
 
89 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>