17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2035 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2035  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1151  hypothetical protein  39.19 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4431  hypothetical protein  32 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.619358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1410  hypothetical protein  33.87 
 
 
76 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  34.25 
 
 
86 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  32.39 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  29.49 
 
 
88 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  28.77 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  30.99 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  25.68 
 
 
76 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  29.49 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2604  hypothetical protein  31.43 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  29.17 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  30.3 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  29.49 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  26.39 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>