25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1410 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1410  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  160  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1151  hypothetical protein  37.84 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4431  hypothetical protein  27.54 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.619358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  32.26 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2035  hypothetical protein  33.87 
 
 		 75 aa  50.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  37.1 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  32.79 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  31.67 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  32.79 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  36.21 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  31.67 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  29.69 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  31.67 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  32.79 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  28.57 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  32.79 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  29.03 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  26.98 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  27.42 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  35.19 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  28.57 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  32.79 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  33.93 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  35.71 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>