56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1180 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  211  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  69.89 
 
 		 97 aa  133  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  59.52 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  53.16 
 
 		 86 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  50.62 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  48.15 
 
 		 86 aa  87  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  45.98 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  45.45 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  46.99 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  47.22 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  47.22 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  46.25 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  45.68 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  47.22 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  43.84 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  42.05 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  39.73 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  38.55 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  39.02 
 
 		 89 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  39.19 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  40.58 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  47.46 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  35.8 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  41.1 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  41.1 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  40.98 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1245  hypothetical protein  40.35 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197075  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  40.98 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0897  hypothetical protein  53.19 
 
 		 50 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  39.33 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  35.71 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  40.68 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2719  hypothetical protein  34.94 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  34.25 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  35.62 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  36.76 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  34.15 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  34.25 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  34.15 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  31.51 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0673  hypothetical protein  51.35 
 
 		 54 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  34.21 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  28.75 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  37.31 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1151  hypothetical protein  31.94 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  36.78 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3444  hypothetical protein  31.94 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.935963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4431  hypothetical protein  26.79 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.619358 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  32.43 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1385  hypothetical protein  53.85 
 
 		 53 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0503  hypothetical protein  46.81 
 
 		 46 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0664  hypothetical protein  46.81 
 
 		 46 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0950  hypothetical protein  30.14 
 
 		 75 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1410  hypothetical protein  28.57 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>