25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0673 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0673  hypothetical protein  100 
 
 
54 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  68.52 
 
 
86 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  49.06 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  51.92 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  54.72 
 
 
86 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  47.06 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  46.15 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  45.1 
 
 
88 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  51.35 
 
 
103 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  41.51 
 
 
86 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  52.27 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  40.38 
 
 
101 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  45.45 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  36.54 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  54.05 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  42.31 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  36.54 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  36.36 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  32.69 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  32.69 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  37.25 
 
 
89 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  40.91 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  32.69 
 
 
89 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>