48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1901 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  190  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  62.67 
 
 
76 aa  101  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  62.67 
 
 
76 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  49.45 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  52.81 
 
 
88 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  51.14 
 
 
88 aa  90.5  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  46.07 
 
 
88 aa  84  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  39.56 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  37.5 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  41.18 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  43.18 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  38.64 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  42.05 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  39.77 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  42.05 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  38.64 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  37.5 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  36.36 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  39.33 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  43.18 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  39.77 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  37.5 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  38.55 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  43.18 
 
 
86 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  42.05 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  39.02 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  39.53 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  37.8 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  40.91 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  38.2 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  38.2 
 
 
86 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  35.56 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2719  hypothetical protein  35.29 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3444  hypothetical protein  43.84 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.935963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  45.45 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  38.81 
 
 
72 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1245  hypothetical protein  49.15 
 
 
59 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  27.27 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  28.09 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  32.95 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  29.41 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  29.49 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  28.74 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1386  hypothetical protein  46.51 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  34.29 
 
 
401 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0673  hypothetical protein  42.31 
 
 
54 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  30.59 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>