59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0567 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  210  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  82.95 
 
 		 88 aa  157  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  78.41 
 
 		 88 aa  153  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  69.32 
 
 		 88 aa  136  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  52.81 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  51.72 
 
 		 86 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  53.93 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  49.45 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1245  hypothetical protein  69.49 
 
 		 59 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  47.19 
 
 		 89 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  46.07 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  49.43 
 
 		 86 aa  86.7  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  44.32 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  47.19 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  43.82 
 
 		 89 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  44.83 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  45.45 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  46.59 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  47.19 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  46.07 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  44.44 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  50.57 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  48.05 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  47.62 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  63.16 
 
 		 74 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  48.86 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  40.23 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  46.07 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  43.84 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  44.68 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  45.59 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  45.59 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  42.17 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  40.91 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  40.91 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  39.29 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1386  hypothetical protein  47.17 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2719  hypothetical protein  36.47 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207392  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  32.22 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  32.88 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  36 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  29.55 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1151  hypothetical protein  34.25 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  32.94 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0673  hypothetical protein  40.38 
 
 		 54 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3444  hypothetical protein  39.76 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.935963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4431  hypothetical protein  32.88 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.619358 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1385  hypothetical protein  58.97 
 
 		 53 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  30.23 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2035  hypothetical protein  29.49 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2604  hypothetical protein  26.92 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0897  hypothetical protein  37.5 
 
 		 50 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0664  hypothetical protein  44.68 
 
 		 46 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0503  hypothetical protein  44.68 
 
 		 46 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  24.66 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1410  hypothetical protein  35.19 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  35.71 
 
 		 401 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>