43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1284 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  159  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  62.67 
 
 
94 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  51.47 
 
 
88 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  48.53 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  45.59 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  45.59 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  44.74 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  50.75 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  49.25 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  48.53 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  42.25 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  44.74 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  44.12 
 
 
86 aa  67  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  42.65 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  44.78 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  43.06 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  45.59 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  39.47 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  41.18 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  41.79 
 
 
86 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  38.81 
 
 
86 aa  59.3  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  49.06 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  39.71 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  43.28 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  40.98 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1386  hypothetical protein  49.02 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  47.17 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  40.3 
 
 
72 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  37.68 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  39.71 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  37.31 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2719  hypothetical protein  34.33 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  39.29 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  37.31 
 
 
85 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  39.62 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  26.87 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  33.85 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  37.74 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  32.31 
 
 
84 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  28.36 
 
 
89 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0673  hypothetical protein  32.69 
 
 
54 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  29.69 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>