17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3444 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3444  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.935963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  43.84 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  43.37 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  44.58 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  43.55 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  38.81 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  36.99 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  39.76 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  31.94 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  36.62 
 
 
91 aa  43.5  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  36.92 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  35.48 
 
 
89 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  30.67 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  32.88 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  30.67 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  35.62 
 
 
86 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>